¿Puede poner un ejemplo más concreto?
Normalmente hay varios flujos de trabajo involucrados; sin embargo, el tema común es que un número de referencia lo une.
Por ejemplo, en PayPal, si necesita transferir dinero de su cuenta bancaria a la cuenta de PayPal, primero tiene que iniciar sesión en PayPal e introducir los detalles, entonces ellos generarán una instrucción de pago [esta tiene los detalles de la cuenta de PayPal y el número de referencia] que usted iría a presentar a su banco. El número de referencia vuelve a PayPal y ellos saben que el dinero proviene de usted.
Otra forma es hacer que PayPal cargue su cuenta directamente en el banco, en este caso ellos ya saben a qué cuenta de PayPal deben acreditar y por lo tanto cuando el débito sea exitoso, acreditarán su cuenta.
Un esquema similar se aplica a varios Comerciantes, usted especifica algún número de referencia mutuamente acordado que permitiría al Comerciante hacer coincidir el pago que usted le hace.