Cada una de las tres agencias no sólo utiliza técnicas diferentes para calcular sus puntuaciones, sino que además no le informan de la puntuación de crédito FICO, que es la que suelen utilizar los prestamistas. Equifax habla de esto en su página de puntuación de crédito mientras que Experian reclama el uso de FICO Score 8 que sí coincide con lo que utilizan algunos prestamistas (pero no todos).
Sin embargo, en tu ejemplo concreto, estás comparando informes extraídos en momentos diferentes. Lo más probable es que haya un saldo de tarjeta de crédito que sea diferente o algo similar entre los dos; ya que su utilización de crédito es uno de los factores más importantes, eso podría ser una cantidad significativa de su puntuación de crédito.
También es posible que Mint esté reportando una puntuación diferente a la de Credit karma. Uno podría estar mostrando tu puntuación FICO y el otro la puntuación propia de la agencia de informes de crédito, o una puntuación FICO diferente (hay diferentes algoritmos FICO, normalmente utilizados para diferentes propósitos), o incluso VantageScore, que es otro algoritmo que tiene un máximo más alto (llega hasta 990); TransUnion habla un poco de esto.
Edición: Efectivamente, Credit Karma está reportando su VantageScore es el modelo 3.0, que tiene un máximo de 850, pero podría ser fácilmente diferente de lo que usa Mint (que no pude encontrar rápidamente).
Mint utiliza el Modelo Equifax (mira en la nota a pie de página 1); utiliza la información de los tres informes, pero utiliza el modelo de Equifax para aplicarlo a esos tres informes para generar la puntuación.