No son equivalentes. En el modelo de regresión lineal (notación matricial), $$ y = X\beta + u,$$
el estimador OLS para $\beta$ es $$\hat \beta_{OLS} = \beta + (X'X)^{-1}X'u.$$
Entonces $$\mathbb E\left(\hat \beta_{OLS} \mid X\right) = \beta + (X'X)^{-1}X'\mathbb E\left(u \mid X\right).$$
Bajo el supuesto que suele llamarse "independencia media del término de error de los regresores", o "exogeneidad estricta de los regresores", $$E\left(u \mid X\right)=0,$$
obtenemos
$$\mathbb E\left(\hat \beta_{OLS} \mid X\right) = \beta$$
Y como se señala en otra respuesta, entonces también se llega por la ley de las expectativas iteradas,
$$\mathbb E\left(\hat \beta_{OLS} \right)= \mathbb E \Big[\mathbb E\left(\hat \beta_{OLS} \mid X\right)\Big] = \mathbb E(\beta) = \beta.$$
La razón por la que la econometría utiliza argumentos condicionales es que, con datos observacionales, los regresores son estocásticos. Pero el marco original en el que se desarrollaron la regresión lineal y los mínimos cuadrados era el de los experimentos controlados, en los que los regresores eran "deterministas", es decir, sus valores los decidía el investigador (de ahí el nombre de "matriz de diseño" que todavía se utiliza a veces). En este caso, no había necesidad de utilizar argumentos condicionales, porque, al ser deterministas, los regresores no estaban/pueden estar caracterizados por una distribución, tener momentos, etc.
Cuando condicionamos una variable aleatoria, la tratamos "como si" fuera "fija/determinista".