En cuanto a tu primera pregunta, la respuesta es 'sí', al menos en tu modelo. Porque si la tasa de interés real, $r_t=i_t-E_t\pi_{t+1}$, es igual a su nivel natural $r^n_t$, entonces en tu modelo $x_t=E_tx_{t+1}$ y $x_t=0$ para todo $t$ es una solución que es consistente con la ecuación dinámica. (Ten en cuenta que otras soluciones son consistentes con la ecuación dinámica en el caso $r_t=r^n_t$ para todo $t$, como por ejemplo $x_t=1$ para todo $t$.)
Según mi experiencia, el nivel natural de la tasa de interés real generalmente se define como el nivel de interés real consistente con que la producción esté en su nivel 'natural', 'a largo plazo', 'de equilibrio' o 'potencial', dada una inflación estable, ausencia de choques en la demanda, etc. Es decir, la tasa de interés real natural, $r^n_t$, es tal que cuando $r^t=r^n_t$ y ciertas condiciones de estabilidad/regularidad se cumplen, entonces $x_t=0. Lee una carta económica del FRBSF para obtener más información.
También podemos ver el nivel natural de la tasa de interés real como la tasa de interés real a la cual la brecha de producción $x_t$ sigue su tendencia $E_tx_{t+1}$, es decir, $x_t=E_tx_{t+1}$. Esta definición es similar a la dada por Knut Wicksell.
En cuanto a tus dos últimas preguntas, puedo decir lo siguiente. En tu modelo, un aumento ceteris paribus en $r^n_t$ aumenta $x_t$ en $\frac{1}{\sigma}$. (Simplemente toma la derivada parcial con respecto a $r^n_t$ en ambos lados de la ecuación dinámica, manteniendo todo lo demás constante.) Esto significa que o la producción, $y_t$, está aumentando, o el nivel natural de producción, $y^n_t$, está aumentando. Sin embargo, si no se pueden realizar tales cambios ceteris paribus, entonces tomar la derivada parcial manteniendo todo lo demás constante no tiene sentido. De hecho, en los nuevos modelos keynesianos, la tasa de interés real natural a menudo es una función de $y^n_t$, y en tales casos no podemos aumentar la tasa de interés real natural sin afectar el nivel natural de producción. Un caso así es cuando $r^n_t=\rho+\sigma(E_ty^n_{t+1}-y^n_t).
Puedo proporcionar ejemplos más concretos, veré si puedo encontrar algunos.