Estoy un poco confundido por el artículo de Carr y Madan. En él los autores escriben que la transformada de Fourier $ c_T(k)$ se define por
\begin{align} \psi_T(v) = \int_{ - \infty}^{\infty} e^{ivk} c_T(k)dk \end{align}
Sin embargo, tradicionalmente se sabe que la fórmula de la Transformada de Fourier es \begin{align} X( \omega) = \int_{- \infty}^{\infty} x(t) e^{ - i \omega t} dt \end{align}
Lo negativo es la diferencia entre ambos.
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Como se ha dicho, es sólo una convención que varía de un campo a otro. Presento varios enfoques diferentes y muestro cómo coinciden, en mi libro More Mathematical Finance.