No creo que haya ninguna fuente que compruebe el origen de cada uno de los monopolios y compare la fracción de monopolios creados por el Estado frente a los que se producen de forma natural.
Además, la afirmación es difícil de validar/falsificar, ya que es muy vaga. ¿Qué significa "casi siempre"? ¿Más del 50% de las veces, más del 60% de las veces o más del 95% de las veces?
Dicho esto, a menudo se menciona en los libros de texto que el gobierno es la razón común detrás de la creación y existencia de los monopolios (por ejemplo, véase Mankiw Principles of Economics 6th ed pp 313).
Además, a partir de una observación casual, sería correcto decir que la mayoría de los monopolios son impuestos por el gobierno. Por ejemplo, el sistema de derechos de autor aplicado por el gobierno otorga a un autor el monopolio de la reproducción de su obra. Según el Oficina de derechos de autor de EE.UU. Desde 1870 han emitido más de 30.000.000 de derechos de autor. Otro ejemplo de monopolio impuesto por el gobierno son las patentes. Según el Statista Sólo en el año 2020 Estados Unidos registró más de 3 millones de patentes. El gobierno también crea monopolios de otras maneras, pero las patentes y los derechos de autor son probablemente los monopolios más numerosos creados por el gobierno.
No he podido encontrar ninguna estadística sobre los monopolios que se producen de forma natural, pero el gran volumen de monopolios creados por la ley de patentes y derechos de autor es astronómico. Creo que sería difícil reunir una lista de 1000-10000 monopolios naturales a lo largo de toda la historia de la humanidad. Incluso si hubiera un millón de ellos, seguiría siendo sólo el 3% del número de derechos de autor emitidos sólo en los Estados Unidos.
No obstante, dado que no hay ningún estudio empírico directo que lo analice, sería justo decir que es muy plausible que la mayoría de los monopolios sean creados por el gobierno, pero no hay pruebas directas que validen o falsifiquen la afirmación.